预言的最终事件，也是Seele试图实现的最高目标。
这一冲击是由亚当和莉莉斯的结合所触发，并最终创造一个继承地球上所有人类的神的存在。
NERV和Seele的目标，是确保由人类而不是使徒来触发第三次冲击，即‘人类补完计划，。
为实现这一计划・人类必须击败守护‘生命之树，的使徒，也正是因为这个原因，才会有以初号机为代表的兵器，来击溃剩下的使徒。
不过说实话，SeMle的高层并没有将死海文书完全解读明白，应该说死海文书上记载的内容・和真正发生的事情并不一样，可以说死海文书的内容只是后来人类经过代代口述，然后经过对神的崇敬，美化出来的版本，如果用真实的事件去记录当时所发生的一切，肯定会有很多地方和神话传说不符，比如说神并不爱人类，神并非有节操，神只不过是个宅男，一个吃饱睡，睡醒了吃的年轻人而已，他甚至没有想过帮助任何生物以及人类，甚至没有创造过所谓的世界。…,
但死海文书有一些地方所记载的没错，那就是上面所记载的预言，按道理来说，因为雷哲的关系，年所发生的事情应该看作第三次，更早的一次是发生在世界之初，那会是正儿八经的神话时代，天使，神，魔鬼，以及人类共存的时代。
那个时代的人类所拥有的科技，甚至比现在还要发达数千年乃至上万年，传说中的亚特兰蒂斯就属于那个时代人类的产物，只不过在第一次冲击中，亚特兰蒂斯，以及所有的天使，魔鬼都消失殆尽，留下的只有残缺的古卷，这是比死海文书还要古老的卷轴，应该说死海文书就是翻译这古卷后的结果。
在古卷中，天使，魔鬼，神，亚特兰蒂斯的灭亡，被称为第一次冲击，但最终并没有被记载下来，古卷中还记载着接下来所会发生的事情，比如说后来所谓的第一次冲击的‘大洪水，，也有人说第一次冲击导致恐龙灭亡，各种说法并不统一。
第二次冲击就是年，亚当解除封印时产生的灾难，而第三次冲击，就是最后的补完计划，让人类重归神的怀抱，或者说让人类成为这个世界新的神灵。
不过应该怎么说，剧情的主角的确是碇真嗣，凌波丽，明日香，但在雷哲看来真正贯穿整个故事发展的人，却是只出现回忆中的女人，碇唯。
更详细地说，把碇唯说成是具有知性美的圣母也毫不为过，她生性淡薄于一切，平和于人生。
跟她在一起，能够让人心底宁静，碇源堂之所以爱她如此之深，就是因为碇源堂一生充满了利用与利用，只有在碇唯这里，他才可以获得心灵的宁静。
虽然不想去改变整个剧情，但雷哲却很想见见这个女人，虽然说碇源堂最终的
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